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成都生物所在不同溫度脅迫下Rhodococcus響應機制方面取得進展
更新日期: 2019-10-08 作者: 陈杨武 文章來源:環境治理與食品安全領域
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 Rhodococcus廣泛用于環境汙染生物修複,如異源物質的降解、重金屬吸附、還原及生物脫硫等。因此,Rhodococcus被認爲是原位生物修複的最佳候選菌株之一。通常,微生物在實驗室條件下都能有效的去除汙染物,然而微生物在原位生物修複過程中常常會遭受到各種各樣的脅迫限制。非生物脅迫是一個值得注意的方面,它不僅會破壞微生物的穩態,而且還會影響到細胞的生物學功能。例如,低溫,常見典型的非生物脅之一,地球生物圈內超過80%地區被低溫覆蓋,並且大多數地區的氣溫隨著季節變化而變化。因此,研究Rhodococcus在不同溫度脅迫下的響應機制對環境原位修複具有重要的潛在意義。 

 中國科學院成都生物研究所环境治理与食品安全领域王臣博士以苯胺高效降解菌株Rhodococcus sp. CNS16GenBank No.MH879823.1)爲研究對象,對其施加不同溫度梯度脅迫(30℃、20℃、10℃)從細胞形態變化、脂肪酸組分變化及轉錄組響應三個方面研究了該菌株的適應機制。研究表明,與30℃條件下相比,CNS16菌株在20℃、10℃條件下細胞形態由短杆狀變爲長杆狀甚至不規則形狀,不飽和脂肪酸比例上調。轉錄組數據研究表明,肽聚糖合成酶基因顯著下調表達、絲狀溫度敏感基因(Fts)顯著上調表達可能與細胞形態變化相關;不飽和脂肪酸合成基因組顯著上調表達可能與脂肪酸組份變化密切相關。本研究也闡述了Rhodococcus在溫度脅迫下抗氧化系統的響應機制:在20℃、10℃條件下,CNS16失去了過氧化氫酶、超氧化物歧化酶等抗氧化酶的活性,但硫氧還蛋白依賴性過氧化物酶基因顯著上調表達可能有利于CNS16在溫度脅迫環境中抵抗氧化脅迫。同時10℃條件下,类胡萝卜素和维生素B2合成基因也顯著上調表達也可能參與抵抗氧化應激。此外,氨基酸代謝、輔酶和維生素代謝、ABC運輸和能量代謝的響應也協同參與了抗環境壓力。本研究爲Rhodococcus在低溫下調控苯胺的降解提供了理論依據。 

 該研究成果以Adaptation mechanisms of Rhodococcus sp. CNS16 under different temperature gradients: Physiological and transcriptome (DOI10.1016/j.chemosphere.2019.124571)爲題,發表在國際環境科學與生態學領域期刊Chemosphere上。中國科學院成都生物研究所王臣博士为論文第一作者,谭周亮研究員为論文通讯作者。本研究得到中國科學院成都生物研究所环境与应用微生物学重点实验室开放研究基金计划项目、四川省重点研发计划项目以及中國科學院青年創新促進會项目的支持。 

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